札幌北（札幌市北区北13条）
仙台（仙台市青葉区中央2丁目）
東京・目白（東京都新宿区下落合）
東京・渋谷（東京都渋谷区神宮前） パタゴニア・オーシャン（東京都渋谷区神宮前）※上述「渋谷店」と同一建物内にあるが、出入り口はそれぞれ別個にあり、両店舗は直接接続していない。店名の通り、アウトドア関連商品の中でも、サーフィンをはじめとしたウォータースポーツ関連の商品を中心に販売している。
東京・神田（東京都千代田区神田小川町）
東京・大崎（東京都品川区大崎）※ゲートシティ大崎文化施設棟内
横浜・関内（横浜市中区日本大通）
鎌倉（神奈川県鎌倉市）※鎌倉店が入居する建物内に日本支社のオフィスがある。
名古屋（名古屋市中区丸の内）
大阪（大阪市中央区南船場）
神戸（神戸市中央区）
福岡（福岡市中央区大名）